眾多研究表明,新冠病毒(SARS-CoV-2)的自然宿主很可能是蝙蝠,但其中間宿主存在著多種可能,例如蛇、穿山甲、水貂甚至貓,但至今尚未確定新冠病毒的中間宿主到底是誰(shuí)。
近日,由鐘南山院士牽頭、專職于過(guò)敏反應(yīng)與免疫研究的呼吸疾病國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、廣州醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院陶愛(ài)林教授組織的研究團(tuán)隊(duì)在Healthcare雜志發(fā)表了題為《SARS-CoV-2: Origin, Intermediate Host and Allergenicity Features and Hypotheses》的論文。
該研究試圖破解新冠病毒的中間宿主來(lái)源和過(guò)敏原性,以及這種病毒是如何出現(xiàn)的,它將如何及何時(shí)消失。結(jié)果顯示,嚙齒動(dòng)物可能是SARS-CoV和SARS-CoV-2向人傳播的中間宿主。
為了確定人SARS-CoV-2的中間宿主,研究者以人SARS-CoV-2刺突糖蛋白的滑動(dòng)肽為掃描窗,對(duì)整個(gè)生物數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行了掃描和比對(duì)。結(jié)果表明,有17個(gè)鼠源性多肽片段與人SARS-CoV-2刺激性糖蛋白完全匹配。研究者進(jìn)一步在NCBI BLAST參考蛋白文庫(kù)和非冗余蛋白序列文庫(kù)中驗(yàn)證了這些片段,結(jié)果顯示有7個(gè)片段是大鼠特異性多肽,只存在于小鼠數(shù)據(jù)庫(kù)(Mus或Rattus)而不存在于其他哺乳動(dòng)物數(shù)據(jù)庫(kù)。通過(guò)對(duì)蛋白質(zhì)文庫(kù)的整體蛋白質(zhì)組學(xué)掃描,發(fā)現(xiàn)特征片段HAIHVSGT在褐家鼠和小鼠中特異存在。因此,嚙齒動(dòng)物可能是SARS-CoV和SARS-CoV-2向人傳播的中間宿主。
這是當(dāng)前關(guān)于新冠病毒中間宿主的一個(gè)全新發(fā)現(xiàn),這個(gè)研究開展了一個(gè)關(guān)于“病毒感染種群的自限性假說(shuō)”。
陶愛(ài)林團(tuán)隊(duì)認(rèn)為,當(dāng)一個(gè)新的冠狀病毒突變后,某一類或幾類特定MHC基因型的個(gè)體成為易感個(gè)體,當(dāng)易感個(gè)體消亡或者獲得免疫自愈后,那些占絕大多數(shù)無(wú)癥狀個(gè)體和感染后的痊愈個(gè)體依然帶著該突變病毒,這種新病毒就在種群內(nèi)部流傳而不引起疾病流行;當(dāng)條件合適時(shí),病毒累積的突變達(dá)到一定程度,會(huì)使得另一類MHC基因型的個(gè)體染病,從而進(jìn)入下一個(gè)流行季,如此開始群體內(nèi)新的循環(huán)。當(dāng)病毒獲得了跨種間傳播的突變,則在新種內(nèi)一樣開始演變?yōu)槿静?流行-無(wú)癥狀攜帶的逐步平衡。此規(guī)律在包括人在內(nèi)的哺乳動(dòng)物和其他動(dòng)物中莫不如此。當(dāng)病毒獲得了跨種間傳播的突變且累積到與全部MHC位點(diǎn)發(fā)生強(qiáng)結(jié)合時(shí),即成為超級(jí)病毒,這種超級(jí)病毒對(duì)該種群存在滅絕的威力,但該超級(jí)病毒也會(huì)隨著該種群的滅絕而消失。
在經(jīng)過(guò)20個(gè)月研究后,陶愛(ài)林團(tuán)隊(duì)最終證實(shí)了這個(gè)假說(shuō)。
該研究通過(guò)對(duì)新型病毒的刺突蛋白的滑動(dòng)序列片段進(jìn)行全面的氨基酸序列分析,證實(shí)蝙蝠是新型冠狀病毒SARS-CoV-2的天然宿主,再通過(guò)嚙齒動(dòng)物傳遞給人類。同時(shí),通過(guò)過(guò)敏原性對(duì)比分析發(fā)現(xiàn),新型冠狀病毒SARS-CoV-2和2002-2003年在廣東爆發(fā)的SARS病毒即SARS-CoV表現(xiàn)出相似的致敏性,但二者之間具有不同的HLA等位基因-多肽結(jié)合力,提示兩種病毒特定感染的人群不同,癥狀相似但不同。通過(guò)對(duì)與多肽具有高結(jié)合力的HLA I類5個(gè)位點(diǎn)和II類9個(gè)位點(diǎn)在人群中的比例,得到:在沒(méi)有任何干預(yù)的情況下,約7.36%的中國(guó)人感染新冠病毒后癥狀明顯,而92%的人即使感染卻不顯示癥狀或癥狀不明顯。不同國(guó)家的不同基因型分布頻率不同,感染率和重癥率也有所差異,感染新冠后如未經(jīng)干預(yù),約4.68%的美國(guó)人將顯示嚴(yán)重癥狀,而感染不顯示癥狀的人群約為95%——這類無(wú)癥狀的個(gè)體是病毒得以長(zhǎng)期存在并傳播的客觀條件,而且,由于這類個(gè)體即使感染了病毒也不會(huì)啟動(dòng)后續(xù)的炎癥反應(yīng),沒(méi)有明顯癥狀,因此,其接種效應(yīng)不明顯,但疫苗接種后往往容易會(huì)將這部分人群統(tǒng)計(jì)算入疫苗接種成功的人群。
研究者結(jié)合該實(shí)驗(yàn)室在2011~2012年對(duì)SARS病毒抗體的群體調(diào)查數(shù)據(jù),認(rèn)為:冠狀病毒在人群中存在,在全體人群成功免疫之前,不會(huì)在人群中消失。如果該研究的結(jié)論正確,老鼠作為中間宿主成為事實(shí),貓、老鼠等與人類密切接觸動(dòng)物攜帶冠狀病毒與并進(jìn)行傳播,那么,冠狀病毒在人群中將難以滅絕。
研究者建議,采用過(guò)敏原性弱化了的弱病毒進(jìn)行提前免疫方能抵御強(qiáng)病毒,天花與牛痘的實(shí)例就是這一措施的重要實(shí)證。全基因組抗原均進(jìn)行了過(guò)敏原性弱化后的疫苗將是安全的、有效的疫苗,這將是未來(lái)新冠疫苗的新目標(biāo)。其次,建議聯(lián)合監(jiān)測(cè)特殊氣象因素的變化和病毒變異,并早期接種低過(guò)敏原性病毒,將是對(duì)抗該病毒的理想預(yù)防方式。
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